1533 року іспанські конкістадори встановили контроль над більшою частиною імперії, а 1572 року держава інків припинила своє існування. Є гіпотеза, що останнім незалежним притулком інків є незнайдене місто (країна) Пайтіті (до середини або кінця XVIII століття).
Пісарро (Pizarro) Франсиско (між 1470 і 1475-1541), іспанський конкістадор. У 1513-1535 роки брав участь у завоюванні Панами і Перу, відкрив частину Тихоокеанського узбережжя Південної Америки із зал. Гуаякіль і Західну Кордильєру Анд, розграбував і знищив державу інків Тауантінсуйу, заснував міста Ліма і Трухільо.
Епідемія завезеної європейцями чорної віспи, до якої в аборигенів Нового Світу не було імунітету, дійшла від Карибського басейну і до інків. Від хвороби, як і багато його підданих, імовірно, помер і верховний правитель інків Уайна Капак.
Держави ацтеків та інків були завойовані іспанськими конкістадорами в 16-му столітті. Після відкриття Нового Світу (Америки) було отримано звістки про золото, яке у великих кількостях було в індіанців.